Perbedaan antara cDNA dan perpustakaan genom | cDNA vs Genomic DNA Library
Perbedaan Kunci - cDNA vs Perpustakaan Genom
Ada dua jenis utama perpustakaan DNA yang dibangun oleh para ilmuwan yang menggunakan teknik rekayasa genetika. Itu adalah perpustakaan cDNA dan perpustakaan Genomik. Perbedaan utama antara perpustakaan cDNA dan genomik adalah bahwa pustaka 'cDNA berisi DNA komplementer kloning dari total mRNA organisme sementara perpustakaan genomik DNA mengandung fragmen kloning dari seluruh genom suatu organisme. Perpustakaan DNA genom lebih besar dari perpustakaan cDNA.
DAFTAR ISI1. Ikhtisar dan Perbedaan Kunci
2. Apa itu Perpustakaan cDNA
3. Apa itu Perpustakaan Genom
4. Perbandingan Side by Side - cDNA vs Genomic Library
5. Ringkasan
Apakah itu Perpustakaan Genomik?
Perpustakaan genomik DNA adalah kumpulan klon yang mengandung fragmen DNA genom total organisme. Ini berisi seluruh DNA genom organisme itu, termasuk urutan pengkodean dan nonkode. Pembangunan perpustakaan genom dilakukan oleh teknologi DNA rekombinan yang diikuti dengan kloning (rekayasa genetika). Ada berbagai langkah yang terlibat dalam konstruksi seperti yang ditunjukkan pada gambar 01. Prosesnya dimulai dengan isolasi DNA genomik. Dengan menggunakan protokol ekstraksi DNA yang sesuai, DNA genomik total organisme harus diisolasi. Kemudian DNA harus diubah menjadi ukuran yang mudah diatur atau ke dalam fragmen spesifik dengan restriksi endonuklease (enzim pemotongan DNA). DNA terfragmentasi harus dimasukkan ke dalam vektor yang menggunakan ligas DNA (enzim penyatu DNA). Vektor adalah organisme yang mereplikasi dirinya sendiri. Plasmid dan bakteriofag umumnya digunakan vektor dalam teknologi DNA rekombinan. Vektor ligasi ini dikenal sebagai molekul DNA rekombinan karena keduanya membawa sekumpulan DNA sendiri dan dimasukkan. Rekombinan vektor ditambahkan ke bakteri inang dan dibuat untuk menyerap vektor rekombinan di dalam sel bakteri. Bakteri dengan vektor rekombinan (plasmid) harus ditanam dalam media kultur. Selama penggandaan bakteri, DNA bakteri, bersama dengan plasmid rekombinan, meniru genom mereka dan menghasilkan klon. Klon ini mengandung seluruh genom organisme sumber. Makanya, itu disebut perpustakaan genomik. Plasmid dapat dengan mudah dipisahkan dari DNA kromosom bakteri untuk membangun perpustakaan genom organisme tersebut. Jika organisme tertentu mengandung gen yang tertarik, mudah untuk mendeteksi di perpustakaan genom dengan hibridisasi menggunakan probe molekuler (spidol).
Gambar_1: Konstruksi sebuah perpustakaan genom
Perpustakaan cDNA adalah kumpulan klon DNA pelengkap (cDNA) yang disintesis dari total mRNA organisme. Prosedur konstruksi melibatkan berbagai langkah. Pemurnian total mRNA dari organisme adalah langkah pertama yang terlibat. MRNA terisolasi diubah menjadi untai cDNA dengan proses yang disebut reverse transcription. Transkripsi terbalik difasilitasi oleh enzim yang disebut reverse transcriptase. Ini menggunakan primer 3 'kecil dan memulai sintesis untai cDNA pertama yang melengkapi mRNA template untai. Hasil cDNA terdoping ganda diubah menjadi fragmen yang lebih kecil menggunakan endonuklease restriksi dan dimasukkan ke dalam vektor yang sesuai. Molekul rekombinan yang dibangun ini kemudian ditambahkan ke dalam organisme inang dan ditanam dalam media kultur untuk menghasilkan klon. Kumpulan klon yang mengandung fragmen cDNA dari organisme dikenal sebagai perpustakaan cDNA. MRNA matang yang diiris seluruhnya tidak mengandung intron dan area peraturan. Oleh karena itu fragmen non-coding tidak ada di perpustakaan cDNA tidak seperti di perpustakaan genomik.
perpustakaan cDNA penting untuk analisis daerah pengkodean, fungsi gen, ekspresi gen dll
Gambar_2: Konstruksi perpustakaan cDNA
Apa perbedaan antara cDNA dan Perpustakaan Genomik?
- diff Article Middle before Table ->
cDNA vs Genomic Library
cDNA library adalah kumpulan klon yang mengandung DNA pelengkap ke mRNA organisme |
|
| Perpustakaan genom adalah kumpulan dari klon yang mengandung DNA genom total organisme. | Urutan Coding vs. Noncoding |
| cDNA hanya berisi urutan pengkodean; itu tidak mengandung intron. | |
| Perpustakaan genom terdiri dari seluruh DNA genom termasuk DNA nonkoding (intron dan regulasi). | Ukuran |
| perpustakaan cDNA berukuran kecil. | |
| Perpustakaan genom besar. | Bahan Mulai |
| Materi awal adalah mRNA | |
| Bahan awal adalah DNA. | Keterlibatan Reverse Transcription. |
| Transkripsi terbalik terjadi pada sintesis untai cDNA pertama. | |
| Transkripsi terbalik tidak terjadi. | Ringkasan - Perpustakaan cDNA dan Genom |
Perpustakaan genomis mewakili populasi klon yang mengandung DNA genom total terfragmentasi dari suatu organisme. Perpustakaan cDNA mewakili populasi klon yang mengandung DNA komplementer dari total mRNA organisme. Kloning cDNA hanya berisi urutan yang ditemukan di mRNA sementara kloning genomik berisi sekuens seluruh genom. Inilah perbedaan antara cDNA dan perpustakaan genomik.
Referensi:
1. Haneef, Deena T KochunniJazir. "Perbedaan antara Perpustakaan Genomik dan cDNA. "Perbedaan antara Perpustakaan Genomik dan cDNA. N. hal., n. d. Web. 15 Feb.2017
2. Stekel, Dov J., Yoav Git, dan Francesco Falciani. "Perbandingan Ekspresi Gene dari Beberapa Perpustakaan cDNA. "Penelitian Genom. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Desember 2000. Web. 16 Feb. 2017
3. "Layar Perpustakaan Genom untuk Gen yang Terlibat dalam Toleransi n-Butanol di Escherichia coli. "Layar Perpustakaan Genom untuk Gen yang Terlibat dalam Toleransi n-Butanol di Escherichia coli. N. hal., n. d. Web. 16 Feb. 2017
Gambar Courtesy:
1. "Pembentukan Perpustakaan cDNA" oleh PhD Dre di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY-SA 3. 0) via Commons Wikimedia
2. "Konstruksi Perpustakaan Genomik" Oleh Aluquette - Karya Sendiri (CC BY-SA 3. 0) melalui Commons Wikimedia
