Perbedaan antara Gel Elektroforesis dan SDS Page | Gel Elektroforesis vs SDS Page

Perbedaan Kunci - Gel Elektroforesis vs SDS Page

Gel elektroforesis adalah teknik yang memisahkan makromolekul di medan listrik. Ini adalah metode umum dalam biologi molekuler untuk memisahkan DNA, RNA dan protein dari campuran sesuai dengan ukuran molekulernya. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein dari campuran protein berdasarkan ukurannya. Gel elektroforesis adalah istilah yang digunakan untuk merujuk pada teknik normal yang digunakan untuk pemisahan DNA, RNA, dan protein sedangkan SDS Page adalah satu jenis elektroforesis gel. Inilah perbedaan utama antara elektroforesis gel dan SDS Page.

DAFTAR ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Kunci

2. Apa Gel Elektroforesis

3. Apa itu SDS Page

4. Side by Side Comparison - Gel Elektroforesis vs SDS Page

5. Ringkasan

Apa itu Elektroforesis Gel?

Gel elektroforesis adalah teknik umum yang digunakan di laboratorium untuk memisahkan molekul berulir seperti DNA, RNA, protein, dan lain-lain dari campurannya. Gel digunakan dalam elektroforesis gel. Ini bertindak sebagai saringan molekuler. Ada dua jenis gel yang digunakan dalam elektroforesis gel yaitu agarose dan poliakrilamida. Pemilihan sel dan gel merupakan faktor penting yang harus dipertimbangkan dalam elektroforesis gel karena ukuran pori gel harus dimanipulasi dengan hati-hati untuk pemisahan molekul yang baik melalui elektroforesis gel. Gel elektroforesis memiliki medan listrik yang terhubung ke dua ujung gel. Salah satu ujung gel menunjukkan muatan positif sementara ujung lainnya bermuatan negatif.

DNA dan RNA adalah molekul bermuatan negatif. Begitu mereka dimasukkan ke dalam gel dari ujung negatif gel dan diaplikasikan ke medan listrik, mereka bermigrasi melalui pori-pori gel ke ujung gel yang bermuatan positif. Kecepatan migrasi bergantung pada muatan dan ukuran molekulnya. Molekul yang lebih kecil mudah bermigrasi melalui pori-pori gel daripada molekul yang lebih besar. Oleh karena itu, molekul yang lebih kecil menempuh jarak jauh melalui gel dan molekul yang lebih besar melakukan perjalanan dalam jarak dekat. Untuk mengamati perjalanan molekul di gel, khusus jenis pewarna digunakan. Medan listrik diterapkan untuk periode waktu tertentu dan berhenti untuk mencegah hilangnya molekul dan menjaga agar molekul tetap berada pada posisi yang mereka tempuh. Band yang berbeda dapat diamati pada gel.Band ini mewakili molekul dengan ukuran berbeda. Oleh karena itu, elektroforesis gel berguna untuk membedakan molekul sesuai ukurannya.

Gel elektroforesis dimasukkan ke dalam berbagai teknik sebagai teknik preparatif dalam biologi molekuler seperti PCR, RFLP, kloning, sekuensing DNA, blotting selatan, pemetaan genom, dan lain-lain.

Gambar 01: Gel Agarose elektroforesis

Apakah itu Halaman SDS?

Sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS Page) adalah jenis elektroforesis gel yang digunakan untuk memisahkan protein. Ketika elektroforesis gel digunakan untuk memisahkan protein, diperlukan perawatan khusus karena protein tidak bermuatan negatif seperti DNA dan RNA dan tidak bermigrasi ke arah akhir positif atau akhir yang negatif. Oleh karena itu, protein didenaturasi dan dilapisi dengan muatan negatif sebelum elektroforesis gel. Hal ini dilakukan dengan menggunakan deterjen yang disebut sodium dodecyl sulfate (SDS). Elektroforesis gel yang menggunakan SDS dan gel poliakrilamida untuk media pendukung dikenal dengan SDS Page. Teknik ini biasa digunakan dalam biokimia, genetika, forensik dan biologi molekular.

Selama SDS Page, protein dicampur dengan SDS. SDS membentangkan protein menjadi bentuk linier dan melapisinya dengan muatan negatif yang proporsional dengan massa molekulnya. Karena muatan negatif, molekul protein bermigrasi ke arah muatan positif dari gel dan memisahkannya sesuai dengan massa molekulnya. Di SDS Page, poliakrilamida digunakan sebagai pendukung padat gel. Pemisahan protein yang sebenarnya terutama bergantung pada sifat gel. Oleh karena itu, preparasi gel poliakrilamida harus dilakukan dengan hati-hati dan konsentrasi poliakrilamida yang benar harus digunakan. Gel poliakrilamida menunjukkan resolusi tinggi dari gel agarosa. Oleh karena itu, SDS Page dianggap sebagai teknik resolusi tinggi untuk pemisahan protein.

SDS Page adalah jenis gel elektroforesis denaturasi. Ini memiliki batasan utama dalam analisis protein. Karena SDS mendemonstrasikan protein sebelum pemisahan, tidak memungkinkan pendeteksian aktivitas enzimatik, interaksi pengikatan protein, kofaktor protein, dan lain-lain.

Gambar 02: Halaman SDS

Apa perbedaan antara Gel Elektroforesis dan SDS Page?

- Gelombang Elektroforesis Gel elektroforesis adalah metode yang dilakukan untuk memisahkan makromolekul dengan menggunakan medan listrik.

SDS Page adalah teknik elektroforesis gel beresolusi tinggi yang digunakan untuk memisahkan protein berdasarkan massanya.
Gel Run	Dapat dilakukan secara horizontal atau vertikal.
Halaman SDS selalu berjalan secara vertikal.
Dasar Pemisahan	Pemisahan terjadi sesuai dengan muatan dan ukurannya.
Pemisahan protein terjadi sesuai dengan massa dan muatan.
Resolusi	Agarose gel elektroforesis memiliki resolusi rendah dan elektroforesis gel poliakrilamida memiliki resolusi yang lebih tinggi
SDS Page memiliki resolusi yang lebih baik.
Denaturasi	Gel elektroforesis mencakup teknik denaturing dan non denaturing.
SDS Page mendenaturasi protein sebelum pemisahan.
Ringkasan - Gel Elektroforesis vs SDS Page	Gel elektroforesis adalah teknik umum yang digunakan untuk pemisahan dan analisis DNA, RNA dan protein berdasarkan ukuran dan muatannya. Ada dua tipe utama elektroforesis gel yaitu elektroforesis gel agarose dan elektroforesis gel poliakrilamida. Gel agarose digunakan terutama untuk pemisahan asam nukleat; Bila diperlukan resolusi yang lebih tinggi, gel poliakrilamida digunakan. SDS Page adalah jenis elektroforesis gel yang biasa digunakan untuk memisahkan campuran protein yang kompleks. Ini dianggap sebagai teknik pemisahan protein resolusi tinggi. Ini adalah perbedaan antara elektroforesis gel dan SDS Page.

Referensi:

1. Nowakowski, Andrew B., William J. Wobig, dan David H. Petering. "Native SDS-PAGE: Pemisahan Elektroforesis Resolusi Tinggi Protein Dengan Retensi Properti Asli Termasuk Ion Logam Terikat. www. ncbi nlm. nih. gov. N. hal., Mei 2014. Web. 7 Apr. 2017

2. Stellwagen, Nancy C. "Elektroforesis DNA dalam gel agarosa, gel poliakrilamida dan larutan bebas. "Elektroforesis. Perpustakaan Nasional U. S., Juni 2009. Web. 07 Apr. 2017

Gambar Courtesy:

1. "Gelelektrophoreseapparatur" (CC BY-SA 3. 0) melalui Commons Wikimedia

2. "DNA Agarose gel electrophoresis" Oleh Sekolah Sumber Daya Alam dari laboratorium Ann Arbor - DNA (CC BY 2. 0) via Commons Wikimedia