Perbedaan antara Genotip dan Urutan | Genotyping vs Sequencing
Perbedaan Kunci - Genotip vs Sequencing
Genotip dan sekuensing adalah dua teknik yang dilakukan untuk mendapatkan informasi tentang asam nukleat, terutama DNA organisme. Perbedaan utama antara genotip dan sekuensing adalah bahwa genotip adalah proses untuk menentukan varian genetik yang dimiliki individu dengan menggunakan spidol sedangkan urutannya adalah penentuan urutan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen DNA yang diberikan.
DAFTAR ISI
1. Ikhtisar dan Perbedaan Kunci
2. Apa itu Genotyping
3. Apa yang Sequencing
4. Perbandingan Side by Side - Genotyping vs Sequencing
5. Ringkasan
Apa itu Genotip?
Genotip adalah penentuan susunan genetik seseorang yang menggunakan urutan DNA dan spidol dan perbandingan dan identifikasi pewarisannya. Genotip penting dalam biologi evolusioner, biologi kependudukan, taksonomi, ekologi, dan genetika organisme. Hal ini dapat dilakukan dengan teknik yang berbeda termasuk sekuensing DNA, reaksi rantai polimerase, polimorfisme fragmen panjang fragmen (RFLP), deteksi polimorfik acak yang diperkuat, polimorfisme fragmen panjang fragmen (AFLP), mikroarray DNA, dan lain-lain.
Genotiping melibatkan sekuensing fragmen kecil sekuens DNA tertentu dan menemukan keterkaitan komposisi genetik dengan individu lain yang menggunakan penanda genetik. Ini menentukan polimorfisme nukleotida tunggal (SNPs) di antara individu atau alel spesifik. Genotip berlaku untuk berbagai organisme termasuk manusia. Hal ini juga berlaku untuk mikroorganisme seperti virus, jamur dll dan dapat digunakan untuk menentukan varian genetik mereka dengan profil referensi. Pada epidemiologi molekuler dan mikrobiologi forensik, pengendalian patogen, terutama mikroorganisme, dilakukan dengan informasi yang diperoleh dari genotip. Genotip sangat penting dalam analisis silsilah. Manusia genotip untuk mengkonfirmasi keibuan dan keibuan. Genotipe akan mengungkapkan alel gen dominan dan resesif yang menentukan sifat-sifat spesifik.
Gambar_1: Genotip RFLP
Apa itu Sequencing?
Sequencing adalah proses penentuan urutan nukleotida yang benar dalam fragmen DNA atau RNA yang diberikan. Hampir semua informasi yang dibutuhkan untuk pertumbuhan dan perkembangan organisme dikodekan dalam genomnya. Ketersediaan teknik untuk memproduksi dan memisahkan beberapa ratus nukleotida fragmen nukleatida panjang menyebabkan pengembangan prosedur penentuan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan.Berbagai jenis metode sekuensing tersedia saat ini. Metode sekuensing ini, bersama dengan teknologi untuk pembuatan perpustakaan genom yang mewakili seluruh genom suatu organisme, memfasilitasi sekuens seluruh genom organisme tersebut, membuat analisis mendalam tentang struktur gen, fungsi gen, lokasi gen, ekspresi gen, pemetaan gen, daerah peraturan gen, dll.
Genom total banyak virus, beberapa bakteri, archaebacteria, ragi dan beberapa organisme lainnya telah diurutkan dan dipetakan. Proyek genom manusia telah memungkinkan untuk membuat urutan dan memetakan seluruh genom manusia dan menerbitkan draf pertamanya pada tahun 2003. Ini adalah tonggak utama dalam kemajuan biologi. Urutan genom manusia sekarang digunakan di sektor medis untuk mengidentifikasi penyebab genetik penyakit langka, risiko penyakit layar pada bayi baru lahir, mengidentifikasi rincian genetik dari berbagai jenis kanker, mengembangkan terapi baru, dan mengembangkan alat diagnostik baru, dan lain-lain.
Di dunia tumbuhan genom padi dan genom Arabidopsis telah diurutkan. Pengetahuan tentang urutan ini niscaya akan merevolusi pemahaman kita tentang bagaimana fungsi sel dan organisme.
Gambar_2: Sebuah autoradiografi sekuens sanger
Apa perbedaan antara Genotip dan Sequencing?
- diff Article Middle before Table ->
Genotyping vs Sequencing |
|
Genotyping adalah proses penentuan komposisi genetik seseorang dan memeriksa kelompok atau taksonomi organisme tersebut. | Sequencing adalah proses penentuan urutan nukleotida yang tepat dari fragmen DNA atau RNA yang diberikan. |
Teknik | |
RFLP, sekuens gen, PCR, microarray DNA, AFLP, dll. | Urutan sanger, urutan Gilbert, Pyrosequencing, Sequencing Generasi Berikutnya, sekuensing senapan dll. |
Kekhawatiran Utama | |
Ini lebih prihatin tentang apakah perbedaan genotipe memberikan perbedaan fenotipe yang sebenarnya. | Ini lebih mementingkan urutan nukleotida dan perbedaan dan perubahannya dengan organisme lainnya. |
Ringkasan - Genotip vs Sequencing
Genotip dan sekuensing berguna untuk mempelajari informasi genetik organisme. Genotip adalah proses penentuan variasi genotipe di antara individu dan menemukan kategori mereka. Sequencing adalah proses menentukan urutan nukleotida yang benar pada fragmen yang tertarik atau daerah DNA. Kedua teknik tersebut memberikan informasi penting tentang gen dan genom.
Referensi:
1. "Metode genotip. "Metode dalam biologi molekular (Clifton, N. J.). Perpustakaan Nasional U. S., n. d. Web. 20 Februari 2017.
2. Akey, J. M., D. Sosnoski, E. Parra, S. Dios, K. Heister, B. Su, C. Bonilla, L. Jin, dan M. D. Shriver. "Analisis Curve Curve SNPs (McSNP ): Pendekatan Gel-Free dan Murah untuk Genotip SNP. "BioTechniques 30. 2 (2001): 358-67. Web.
Gambar Courtesy:
1. "RFLP genotyping" Oleh (tidak diketahui) - Institut Kesehatan Nasional (Domain Publik) melalui Commons Wikimedia
2."Radioaktif Fluorescent" Oleh Abizar di Wikipedia bahasa Inggris (CC BY-SA 3. 0) melalui Commons Wikimedia