Perbedaan antara Exome dan Transcriptome | Exome vs Transcriptome

Perbedaan Kunci - Exome vs Transcriptome

Gen berisi daerah pengkodean dan nonkode di dalamnya. Urutan kode dikenal sebagai ekson, dan urutan non-coding dikenal sebagai intron. Urutan nukleotida dari ekson gen merupakan kode genetik gen untuk mensintesis protein spesifik. Oleh karena itu, ekson tetap berada dalam molekul mRNA. Total wilayah ekson genom dikenal sebagai exome, dan ini adalah bagian penting dari genom. Kode genetik gen diubah menjadi kode genetik molekul mRNA, yang dibutuhkan untuk produksi protein. Seluruh molekul mRNA ditranskripsi dalam sel atau populasi sel pada suatu waktu dikenal sebagai transkriptome. Perbedaan utama antara exome dan transkriptome adalah bahwa exe

mewakili urutan daerah ekson dari genom sementara transkriptome mewakili mRNA total sel atau jaringan pada waktu tertentu.

DAFTAR ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Kunci

2. Apa itu Exome

3. Apa itu Transcriptome

4. Side by Side Comparison - Exome vs Transcriptome

5. Ringkasan

Apa itu Exome?

Gen terdiri dari rangkaian ekson, intron dan peraturan. Exon adalah daerah gen yang ditranskripsi menjadi urutan mRNA selama transkripsi. Intron dan daerah non-coding lainnya dihapus selama transkripsi. Urutan nukleotida ekson menentukan kode genetik gen yang mensintesis protein spesifik yang dikodekannya. Hanya ekson yang tertinggal dalam mRNA protein. Koleksi ekson dalam genom dikenal sebagai exome organisme. Ini merupakan bagian dari genom yang diekspresikan dalam gen. Pada manusia, exome menyumbang 1% dari genom. Ini adalah bagian pengkode protein dari genom manusia.

Gambar 01: Exome

Apa itu Transkripsikan?

transkepteks adalah kumpulan semua transkrip pengkodean protein dan non-coding (RNA) dalam jaringan tertentu. Transcriptome mewakili kumpulan molekul mRNA total yang diekspresikan oleh gen dalam sel atau jaringan. Transkrip kromosom sel dapat divariasikan dengan transkriptom dari jenis sel yang lain. Transkriptom juga dinamis - berubah seiring waktu untuk merespons rangsangan internal dan eksternal. Bahkan di dalam jaringan yang sama atau dalam tipe sel yang sama, transkrip bisa berubah setelah beberapa menit.

Transkripsi berbeda dengan exome organisme. Transcriptome hanya mencakup urutan exom yang diekspresikan.Meskipun exome sel tetap sama, transcriptome berbeda antar sel karena ekspresi gen tidak sama untuk semua sel atau jaringan. Hanya gen penting yang diekspresikan dalam sel dan jaringan yang berbeda. Ekspresi gen adalah proses spesifik tisu atau sel. Hal ini diatur oleh berbagai faktor termasuk faktor lingkungan. Oleh karena itu, transkrip dapat bervariasi dengan kondisi lingkungan eksternal.

Transcriptome digunakan sebagai prekursor untuk studi proteomik. Semua protein berasal dari urutan mRNA. Modifikasi translasi dapat menyebabkan perubahan protein. Namun, transkriptome memberikan informasi dasar penting untuk studi proteomik.

Gambar 02: Transkripsi sel induk embrio

Apa perbedaan antara Exome dan Transcriptome?

- diff Article Middle before Table ->

Exome vs Transcriptome

Exome adalah kumpulan wilayah pengkode protein dari gen.

Transcriptome adalah kumpulan semua RNA yang ditranskripsi termasuk mRNA.
Contoh	Exome dipelajari dengan menggunakan sampel DNA.
Transcriptome dipelajari dengan menggunakan sampel RNA.
Metode Studi	Urutan exome keseluruhan adalah metode mempelajari exome.
RNA sequencing adalah metode untuk mempelajari transkriptome.
Ringkasan - Exome vs Transcriptome	Exon adalah urutan pengkodean gen dan menentukan urutan mRNA protein. Kumpulan urutan pengkodean (exons) ini dikenal sebagai exome organisme. Gen ditranskrip ke molekul mRNA sebelum membuat protein. Molekul mRNA total dari sel atau jaringan pada waktu tertentu dikenal sebagai transkriptome. Transcriptome mewakili gen yang secara aktif diekspresikan ke dalam mRNA pada waktu tertentu. Transcriptome adalah sel dan jaringan yang spesifik dan mempengaruhi kondisi lingkungan. Inilah perbedaan antara exome dan transcriptome.

Referensi:

1. Sarah dkk, "Menangkap Target dan Urutan Paralel Secara Massal Dua Belas Manusia. "Alam. Perpustakaan Nasional U. S., 10 September 2009. Web. 01 Apr. 2017

2. Mutz dkk. "Transkrip analisis menggunakan sekuensing generasi berikutnya. "Elsevier: Artikel Locator. N. hal., Sept. 2012. Web. 01 Apr. 2017

Gambar Courtesy:

1. "Transkrip sel pluripoten" Oleh Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., transkriptom pluripoten (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komunitas Penelitian Stem Cell, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook 1. 24. 1, // www. bertengger. org. - [1] DirectStemBook Gambar 2 Transkrip dari sel pluripoten. Grskovic, M. dan Ramalho-Santos, M., transkriptom pluripoten (10 Oktober 2008), StemBook, ed. Komunitas Penelitian Stem Cell, StemBook, doi / 10. 3824 / stembook 1. 24. 1, (CC BY 3. 0) melalui Commons Wikimedia