Perbedaan Antara Terjemahan Nick dan Perpanjangan Primer | Nick Translation vs Primer Extension

Perbedaan Kunci - Terjemahan Nick vs Primer Extension

Terjemahan Nick dan ekstensi primer adalah dua teknik penting yang dilakukan dalam biologi molekuler. Perbedaan utama antara terjemahan nick dan perpanjangan primer adalah proses penerjemahan nick menghasilkan probe berlabel untuk teknik hibridisasi lainnya sementara metode penyuluhan primer mengidentifikasi rangkaian RNA spesifik dari campuran dan mengungkapkan informasi tentang ekspresi mRNA.. Kedua teknik sangat penting dan rutin dilakukan di laboratorium penelitian molekuler.

DAFTAR ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Kunci

2. Apa itu Terjemahan Nick

3. Apa itu Primer Extension

4. Perbandingan Side by Side - Terjemahan Nick vs Primer Extension

5. Ringkasan

Apa itu Terjemahan Nick?

Terjemahan Nick adalah teknik penting yang digunakan untuk menyiapkan probe berlabel untuk berbagai teknik biologi molekuler seperti hibridisasi hibridisasi in situ, hibridisasi in situ. Ini adalah in vitro metode pelabelan DNA. Probe DNA digunakan untuk mengidentifikasi rangkaian DNA atau RNA yang spesifik. Dengan bantuan probe berlabel, fragmen spesifik dapat ditandai atau divisualisasikan dari campuran kompleks asam nukleat. Oleh karena itu, probe berlabel disiapkan dengan menggunakan berbagai teknik untuk digunakan untuk teknik yang berbeda. Terjemahan Nick adalah salah satu metode yang menghasilkan probe berlabel dengan bantuan enzim DNase 1 dan DNA polimerase 1.

Proses penerjemahan nick dimulai dengan aktivitas enzim DNase 1. DNase 1 memperkenalkan torehan tulang punggung fosfat DNA beruntai ganda dengan membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida. Begitu nick dibuat, kelompok nukleotida 3 'OH gratis akan dihasilkan dan enzim DNA polimerase 1 akan bertindak sesuai dengan itu. Aktivitas eksonuklease 5 'sampai 3' dari DNA polimerase 1 menghilangkan nukleotida dari nick ke arah 3 'dari untai DNA. Serentak, aktivitas polimerase enzim DNA polimerase 1 bekerja dan menambahkan nukleotida untuk menggantikan nukleotida yang dilepaskan. Jika nukleotida diberi label, penggantian akan terjadi pada nukleotida berlabel dan akan menandai DNA untuk identifikasi. DNA berlabel yang baru disintesis ini dapat digunakan sebagai probe dalam berbagai reaksi hibridisasi dalam Biologi Molekuler.

Gambar 01: Proses terjemahan Nick

Apa itu Primer Extension?

Ekstensi Primer adalah teknik yang digunakan untuk menemukan urutan RNA spesifik dari campuran RNA dan menemukan ujung 5 dari transkrip mRNA. Hal ini juga digunakan untuk mempelajari struktur RNA dan ekspresi. Metode penyuluhan primer dilakukan dengan primer berlabel atau dengan nukleotida berlabel. Jika primer berlabel digunakan, tidak termasuk kebutuhan pelabelan nukleotida yang digunakan untuk sintesis cDNA. Ada beberapa langkah dalam teknik ini. Dimulai dengan ekstraksi RNA dari sampel. Kemudian primer oligonukleotida berlabel ditambahkan ke dalam campuran bersama dengan bahan yang diperlukan untuk mensintesis cDNA dari urutan RNA tertentu. Primer anneals dengan urutan komplementer dari campuran. Dengan menggunakan urutan anil primer sebagai template, enzim reverse transcriptase mensintesis DNA komplementer (cDNA) dari urutan RNA. Primer annealing dan reverse transcription hanya terjadi bila urutan RNA spesifik ada dalam sampel. Akhirnya, ketika elektroforesis gel denaturasi dilakukan, ukuran urutan RNA dapat ditentukan. Hal ini juga mudah untuk menemukan basis +1 urutan mRNA (urutan inisiasi transkripsi) dengan metode ekstensi primer. Jumlah mRNA yang ada dalam sampel dapat dihitung dengan metode ini jika kelebihan primer digunakan.

Gambar 02: Perpanjangan Primer

Apa perbedaan antara Nick Translation dan Primer Extension?

- diff Article Middle before Table ->

Nick Translation vs Primer Extension

Nick translation adalah proses yang menciptakan probe DNA berlabel untuk berbagai reaksi hibridisasi.
Primer extension adalah teknik yang digunakan untuk menemukan RNA spesifik atau untuk mempelajari ekspresi gen.	Enzim yang Digunakan
enzim DNase 1 dan DNA polimerase digunakan.
Enzim reverse transcriptase digunakan.	Pentingnya
Terjemahan Nick memfasilitasi penandaan urutan DNA tertentu.
Ekstensi Primer memungkinkan deteksi ukuran urutan mRNA spesifik dan jumlah yang ada dalam sampel.	Ringkasan - Terjemahan Nick vs Primer Extension

Terjemahan Nick adalah metode yang digunakan untuk mensintesis probe berlabel berdasarkan aktivitas enzim DNA 1 enzimase DNA dan enzim Benzase 1. Ini adalah metode

in vitro yang digunakan di laboratorium sebelum teknik hibridisasi yang berbeda. Selama penjabaran ulang, aktivitas eksonuclease 5'-3 'dari DNA polimerase 1 menghilangkan nukleotida menjelang aktivitas nick dan polymerase DNA polymerase 1 menggantikan nukleotida yang dilepas dengan nukleotida berlabel di belakang nick. Primer extension adalah metode yang digunakan untuk mendeteksi transkrip RNA spesifik dari campuran dan mengukur ukuran dan jumlah bunga RNA. Ini adalah perbedaan antara terjemahan nick dan perpanjangan primer. Referensi 1. Reid, Alex. "Terjemahan Nick. "Springer. N. hal., n. d. Web. 18 April 2017 2. "Ekstensi Primer. "Diagnostik Nasional. N. hal., n. d. Web. 19 Apr. 2017

3. Kuo, M. T., dan W. Plunkett."Terjemahan Nick kromosom metafase: pelabelan in vitro dari daerah nuklease-hipersensitif dalam kromosom. "Prosiding National Academy of Sciences di Amerika Serikat. U. S. Perpustakaan Nasional Kedokteran, Februari 1985. Web. 19 Apr. 2017

4. Raymond dkk. "Uji PCR sederhana primer kuantitatif untuk pemantauan langsung microRNA dan RNA pendek. "RNA. Hak Cipta 2005 oleh RNA Society, November 2005. Web. 19 Apr. 2017

Gambar Courtesy:

1. "Primer Extension Assay" Oleh Jjnmmnjj - Karya sendiri (CC BY-SA 3. 0) melalui Commons Wikimedia