Perbedaan antara Endonuclease dan Exonuclease | Endonuclease vs Exonuclease

Anonim

Perbedaan Kunci - Endonuklease vs Exonuclease

Sebelum melihat perbedaan antara endonuklease dan eksonuklease, penting untuk mengetahui apa sebenarnya nuklease. Sebuah nuclease adalah enzim yang mampu membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat. Endonuklease dan eksonuklease adalah dua klasifikasi nukleases. Perbedaan utama antara endonuklease dan eksonuklease adalah endonuklease yang menghasilkan ikatan antara nukleotida di dalam molekul asam nukleat sedangkan eksonuklease membelah ikatan antara nukleotida pada ujung 3 'atau 5' dari molekul asam nukleat.

DAFTAR ISI

1. Ikhtisar dan Perbedaan Kunci

2. Apa itu Nuclease

3. Apa itu Endonuklease

4. Apa itu Exonuclease

5. Side by Side Comparison - Endonuclease vs Exonuclease

6. Ringkasan

Apa itu Nuclease?

Sebuah nuklease adalah enzim yang memiliki kemampuan untuk membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida dalam asam nukleat. Ini termasuk dalam kelompok enzim hidrolase karena menghidrolisis ikatan kimia antara nukleotida. Enzim ini sangat penting untuk mekanisme perbaikan DNA alami yang terjadi di dalam sel dan dalam proses bioteknologi seperti kloning gen, teknologi DNA rekombinan, RFLP, AFLP, sekuens gen, terapi gen, pemetaan genom dll.

Ada dua jenis utama nukleases: ribonuklease dan deoxyribonuclease, yang bertindak dan memutus ikatan kimia antara monomer RNA dan DNA. Menurut situs aksi nukleases, mereka dikategorikan menjadi dua kelompok yaitu endonuklease dan eksonuklease. Endonuklease mengenali daerah urutan spesifik asam nukleat dan membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida yang berada di tengah asam nukleat. Exonucleases membelah ikatan fosfodiester antara nukleotida yang berada di ujung asam nukleat.

Gambar 1: Aktivitas Nuclease

Apakah Endonuclease itu?

Endonuklease adalah sejenis nukleases yang memotong asam nukleat dari tengahnya. Ini mengenali urutan nukleotida spesifik asam nukleat dan memutus ikatan kimia antara nukleotida. Mereka juga dikenal sebagai endonuklease pembatasan

karena mereka mencari situs pembatasan tertentu dan membelah ikatan tersebut dan menghasilkan fragmen restriksi. Lebih dari 100 restriksi endonuklease diidentifikasi pada bakteri dan archaea dan diperoleh untuk tujuan komersial.

Endonuklease pembatas banyak digunakan dalam bioteknologi. Mereka memainkan peran penting dalam kloning molekuler. Kebanyakan dari mereka adalah enzim dimer yang terdiri dari dua subunit protein. Dua subunit protein membungkus DNA beruntai ganda dan memisahkan kedua untai dari kedua sisi secara terpisah. Ada ratusan jenis restriksi endonuklease dengan situs pengenalan unik pada bakteri. Karena spesifisitasnya yang tinggi dalam batasan, mereka hanya berpaut pada urutan tertentu. Oleh karena itu, mereka dianggap sebagai alat molekuler yang sangat berguna dalam teknologi DNA rekombinan. Tanpa pembatasan endonuklease, produksi molekul DNA rekombinan tidak mungkin dilakukan. Penciptaan molekul DNA rekombinan adalah langkah dasar teknologi biologis molekuler. Untuk memahami pengenalan urutan unik dengan restriksi endonuklease, contoh berikut akan membantu pembaca. Bam HI adalah endonuklease restriksi yang mencari situs restriksi berikut dalam molekul DNA (situs ditunjukkan dengan huruf merah).

Setelah Bam HI memotong asam nukleat dari tempat restriksi, ia menghasilkan dua fragmen berikut.

EcoRI adalah endonuklease restriksi lain yang sangat berguna dalam teknologi DNA rekombinan yang bekerja di tempat pengenalan pembatasan spesifik dan membelah DNA seperti yang ditunjukkan pada gambar 2.

Gambar 2: EcoRI

Apakah Exonuclease itu?

Exonuclease adalah enzim nuklease yang memisahkan ikatan kimia antara nukleotida pada ujung rantai asam nukleat 3 atau 5. Ini menghancurkan satu nukleotida tunggal di ujung rantai dan menghasilkan nukleosida dengan memindahkan gugus fosfat ke air. Exonucleases ditemukan di archaea, bakteri, dan eukariota. Di E coli, ada 17 eksonuklease yang berbeda yang hadir termasuk poliminas DNA 1, 2 dan 3. Beberapa DNA polimerase menunjukkan aktivitas proofreading eksonuklease 3 'sampai 5'.

Exonucleases penting dalam perbaikan DNA, rekombinasi genetik, pencegahan terjadinya mutasi, stabilisasi genom, dll.

Gambar 3: Tindakan Exonuclease dari RecBCD dari E Coli

Apa perbedaan antara Endonuklease dan Exonuclease?

Endonuklease adalah sejenis enzim nuklease yang memotong ikatan antara nukleotida dalam molekul asam nukleat.

Exonuclease adalah sejenis enzim nuklease yang memotong ikatan antara nukleotida pada ujung 3 'atau 5' dari molekul asam nukleat. Endonuklease menghasilkan fragmen restriksi oleonukleotida

Exonucleotides menghasilkan nukleosida

Fungsi

Mereka memecahkan ikatan fosfodiester dan menghasilkan fragmen restriksi. Tapi mereka melepaskan nukleotida satu per satu.

Mereka memindahkan nukleotida satu per satu dari ujung asam nukleat. Contohnya meliputi Exonuclease I, Exonuclease III, RecBCD (Exonuclease V), eksernuklease RecJ, Exonuclease VIII / RecE, Exonuclease IX. Contoh 9999 Contoh Heterol, Exernuclease III, RecN exonuclease, Exonuclease VIII / RecE, Exonuclease IX, Exonuclease T, Exonuclease X dll. Ringkasan - Endonuclease vs Exonuclease
Nukleases bertanggung jawab untuk memutus ikatan kimia fosfodiester antara nukleotida asam nukleat. Nukleases dapat bekerja di dalam atau di ujung rantai asam nukleat. Menurut situs aksi, dua jenis nukleases utama ditemukan pada organisme. Mereka adalah endonuklease dan eksonuklease. Endonuklease membelah nukleotida dari tengah rantai sementara eksonuklease membelah nukleotida dari ujung rantai asam nukleat. Endonuklease sangat penting dalam teknologi DNA rekombinan karena mereka mengenali urutan dasar spesifik dalam rantai asam nukleat dan memecah ikatan antara nukleotida.
Referensi: 1. "Enzim restriksi. "Enzim restriksi Buka akses artikel | Jurnal akses terbuka | Prosiding Konferensi | Editor | Penulis | Ulasan | peristiwa ilmiah N. hal., n. d. Web. 11 Mar. 2017
2. Pingoud, Alfred, dan Albert Jeltsch. "Struktur dan fungsi endonuklease restriksi tipe II. "Penelitian Asam Nukleat. Oxford University Press, 15 September 2001. Web. 11 Mar. 2017
3. Lovett, Susan T. "DNA exonucleases dari Escherichia coli. "EcoSal Plus. U. S. Perpustakaan Nasional Kedokteran, Desember 2011. Web. 11 Mar. 2017 Gambar Courtesy:
1. "Restriction enzym Eco RI" Oleh Tinastella - Karya Sendiri (Domain Publik) via Commons Wikimedia
2. "HR RecBCD RecA" Oleh Emw2012 - Karya sendiri (CC BY-SA 3. 0) melalui Commons Wikimedia